Masamuda is momenteel nog onderdeel van de Stichting Federatie Broekpolder, het burgerinitiatief dat samen met burgers, overheden en andere belanghebbenden van de Broekpolder een duurzaam natuur- en recreatiegebied maakt. Binnenkort verzelfstandigt Masamuda, met een stevige verankering naar de Federatie Broekpolder.
Masamuda wordt bestuurd en draaiende gehouden door vrijwilligers in nauwe samenwerking met kennisinstituten en erfgoedinstanties/-verenigingen.